Como institución militar, el Estado Mayor General surgió a principios del siglo XIX en Prusia, cuando se formó como parte de las reformas destinadas a adaptar la organización militar a los cambios en la guerra provocados por la aparición de grandes ejércitos nacionales y el rápido desarrollo de la tecnología militar. Desde entonces, ha participado en la creación y el desarrollo del concepto de defensa para todo el país, elaborando planes de guerra, concibiendo y desarrollando la doctrina y la estrategia militar, planificando el desarrollo, la organización y la estructura del sistema de defensa y la preparación para la movilización, organizando la planificación de la guerra y coordinando el desarrollo de la infraestructura y la ordenación del territorio estatal para la guerra. En las Fuerzas Armadas de Serbia, el Estado Mayor General se formó el 5 de febrero de 1876. Su primer jefe fue el general František Aleksandr Zach, y a lo largo de 150 años, el Estado Mayor General estuvo encabezado por algunas de las figuras más significativas de la historia militar serbia: el general Jovan Mišković, los duques Radomir Putnik, Živojin Mišić y Petar Bojović, los coroneles generales y héroes nacionales de Yugoslavia Arso Jovanović, Koča Popović, Peko Dapčević, Ljubo Vučković y Rade Hamović.
El Estado Mayor General desempeñó un papel especial en la preparación de la defensa de la República Federativa de Yugoslavia contra la agresión de la OTAN en 1999.
El Estado Mayor General de las Fuerzas Armadas de Serbia es el máximo órgano de expertos y personal para la preparación y el uso del ejército en tiempos de paz, emergencia y guerra. Propone y ejecuta decisiones para la preparación y el uso de las Fuerzas Armadas de Serbia, dentro de la competencia del Presidente de la República de Serbia y del Jefe del Estado Mayor General de las Fuerzas Armadas de Serbia. Actualmente, el Estado Mayor General de las Fuerzas Armadas de Serbia es una institución militar con cimientos modernos al servicio de la defensa de la República de Serbia y sus ciudadanos.